Die Aufgabe des Kinder- und Jugendärztlichen Dienstes ist es, die Untersuchung aller Kinder vor der Einschulung durchzuführen. Die dabei erhobenen Daten werden ausgewertet und fließen in die Gesundheitsberichterstattung ein. Die Schuleingangsuntersuchung in Hessen ist die einzige Untersuchung, bei der flächendeckend Daten über einen gesamten Jahrgang im Kindesalter erhoben werden.
Der Kinder- und Jugendärztliche Dienst erstellt auch Gutachten auf Veranlassung von Schulen. Durch den Kinder- und Jugendärztlichen Dienst werden Reihenimpfungen durchgeführt und es wird versucht, damit festgestellte Impflücken zu schließen.